我在分析了TCGA数据库中构建了预后模型,现在想用GEO数据作为验证,但下载的数据里并未找到我的基因,查阅文献发现可以用转录该RNA的基因表达量来代替。但具体如何操作并没有学过😭有没有人帮助一下,可有偿
这个看看是否有用https://b23.tv/oe8tthy
看图片是说当未明确注释IncRNA时,根据基因表达计算风险评分,你TCGA本身就是用转录组数据的吧,incRNA是非编码,rna不一样的。不了解具体情况,不排除有的数据集其部分gene没测到,初步给出的建议是换一个geo数据