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生信问题,不太懂这些。

分别说明blastp –query query.fasta –db all –out blast.out –evalue 1e-10 –outfmt 7
每个参数的含义。

grep -v “#” blast.out > blast2.out命令中,-v和“>”代表什么,

说明awk ‘$3>50 && $11< 1e-30’ blast2.out >blast3.out 的含义

说明awk ‘{print $2}’ blast3.out的意义

说明grep -v “#” blast.out | awk ‘$3>50 && $11<1e-30 {print $2}’ | sort | uniq > protein_ids.txt 含义

看下这个 http://t.csdn.cn/C4bbP

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