转录组分析时hisat2进行比对报错
1、这个是我输入的比对命令
~/biosoft/hista2/bin/hisat2 -p 2 --dta -x../rnaseq_study/arabidopsis_genome/index/tair10 -U../rnaseq_study/fastqdata/fastx_results/SRRxxxxxx_filtered.fastq -S SRRxxxxxx.sam &
2、运行结果及报错内容
Warning: Could not open read file "../rnaseq_study/fastqdata/fastx_results/SRRxxxxxx_filtered.fastq" for reading; skipping...
Error: No input read files were valid
(ERR): hisat2-align exited with value 1
3、我的解答思路和尝试过的方法
尝试过检查我的fastq文件的完整性，使用md5sum进行命令如下：
md5sum SRRxxxxxx_filtered.fastq > SRRxxxxxx.md5
md5sum -c SRRxxxxxx.md5
反馈结果显示的是OK：
SRRxxxxxx_filtered.fastq: OK
不知道是哪里出了问题了，希望万能的网友帮忙解答一下。谢谢大家！
~/biosoft/hista2/bin/hisat2 -p 2 --dta -x ../rnaseq_study/arabidopsis_genome/index/tair10 -U ../rnaseq_study/fastqdata/fastx_results/SRRxxxxxx_filtered.fastq -S SRRxxxxxx.sam & 参数后面需要空格