本人在做GEO数据挖掘，选的数据集里这个疾病有多个分型和一个健康集，我想分析每个疾病分型和健康集的差异基因，请问设置分组代码怎么弄？在网上都是只有两个样本进行分析。求生信朋友们分享分享解决方法，谢谢你们！
两种情况，有序的：1.这个可以直接在excel里手动整理好分型1+健康集，分型2+健康集...然后每两组分别都做一遍差异；2.导入rstudio里直接[，]分为多个矩阵分别差异分析。乱序的：整理一个分组信息txt文件，再导入到r排序分组分成多个矩阵，都做一遍差异