您好,我是刚接触生信的一名医学研究员,最近我碰到的一个难题是,在TCGA和GTEX联合分析单基因的泛癌表达时,需要一个一个癌去分析,然后拼接,是否有代码在构建TCGA和GTEx联合矩阵后,进行一个单基因的泛癌表达分析呢
我也有同样的困惑。
https://xenabrowser.net/datapages/ 可以在UCSC下载TCGA、TARGET、GTEX的联合矩阵,再用R删除TARGET的样本数据,然后提取单基因表达数据做分析。