为什么使用了truncate之后文件变成了一堆乱码

我就是想把一个文件中的一些内容写进另一个txt里，然后运行后txt就变成了一堆乱码

with open('file.gff', 'r+') as f1, open('number.count'

                                                                                      , 'r+') as f2, \
    open('新文件.txt', 'w+') as new_file, \
    open('file1.txt', 'r+')as f4:
for i in f2:
    i = i.strip().split("\t")
    print(i)
    list(i)
    new_file.truncate(0)
    id6 = i[0]
    qqq = i[6]
    print(id6)
    if int(qqq) != 0:
        new_file.write(str(id6) + '\n')
    print(qqq)

for w in new_file:
    w1 = w.strip().split('\t')
    print(w)
for q in f1:
    we = []
    qq = q.strip().split('\t')
    if str(qq[2]) == 'gene':
        print(qq[-1])
        we.append(qq[-1])
        print(we)
    q1 = qq[-1][3:21]
    print(q1)
    if id6 == q1:
        f4.write('gene_id        chr     loc1      loc2\n' + i[0:-30] + ' ' + q[-31:-34] + ' ' + q[22:29] + ' ' + q[29:36])

运行之后就是一大堆这个东西：NULNUL

我重复运行了好几次，但就是一堆乱码

（在我用truncate之前一直很好，但是用完就不行了）