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两个代谢组学数据文件如何用编程合并

请教一下:两个组学的数据,两组各有100个,横坐标是样本的,但是纵坐标要合并起来,但是纵坐标比较多,都是一些物质的名称,大部分是重合的,少部分不重合,大约3000左右,重合的留一个,不重合的都要。这样的两个数据可以用R语言实现合并吗

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