您好,我是一名生物技术专业大三在读生,我在最近遇到的构建进化树中遇到了一点疑惑
其次,我在相关文献中还有我应用 建树软件时,看到了氨基酸取代模型LG+G和WAG+G,这是否指的是上文中的(5)模型选择中的替代模型?但是您又在第(5)模型选择中谈到,对于核酸数据而言,可以通过替代模型中的两个要素进行计算机评估,但是对于氨基酸和密码子数据而言,没有什么评估方案。不知道这里的对于氨基酸数据而言没有评估方案和我看到的LG+G和WAG+G怎么理解?
总结一下,我的疑问是,这些模型之间的关系是怎样的?比如说替代模型是不是所有的建树方法的必经之路;而分子进化模型只是对于BL和ML法来说 ?