如果两库可以直连那么left join或者right join写个sql来比对即可，mysql和Oracle 直连可通过安装透明网关之后使用dblink关联查询。
如果无法直连。那么上亿的数据可以对某个字段进行group by进行 count来统计，通过多次分组可大致区分数据丢失的区间，然后将数据过滤到较小的范围时导出excel对数据进行排序来确定丢失数据。
同意楼上小彬哥的,
比如,你这个表里如果一个日期字段,你就group by 日期,然后count行数,两边比较一下,看是哪些天对不上,
如果此时要比较的数据还比较多,那就再指定这个日期作为条件,group by另一个字段,count行数,继续比较两边,以此下去就能找到是哪行对不上了
有没有字段做一些标记呢？比较一下主键就知道了。