csv表格合并统计的问题

最近初学python，想写一个小程序能合并不同表格并去除重复，例如

想统计这三个样本，‘
希望得到的理想状态是

但是我的代码跑出来的结果却是

想了很久都想不出来原因，有人能指点一下吗？

import csv
import time

#创建字典，存放compounds与不同样品之间的关系
total_list = {}

#输出程序开头
print('*'*24)
print('Copyright 2021 Ke Yang\nVersion 1.0_Python\nkeyang@seu.edu.cn')
print('*'*24)

#生成表格头文件
head_name=['Compounds','']
head_name_count = int(input('输入需要处理的样品个数：'))
print('------------------------------------------------') 

#创建初始列表
sample_info_1 = ['1']
for i_info in range(1,head_name_count):
    sample_info_1.append('0')

#导入第一个表格数据，生成初始字典
loading_floder = input('输入所有表格所在文件夹地址：')
loading_name = input('输入第1个表格名（直接复制文件名，不复制.csv）：')
head_name.append(loading_name)
with open(loading_floder + '\\' + loading_name + '.csv', newline='',encoding='utf-8-sig') as sample_list_1:
    reader_1 = csv.reader(sample_list_1)
    for sample_1 in reader_1:
        str_sample_name_1 = ''.join(sample_1)
        total_list[str_sample_name_1] = sample_info_1
print('------------------------------------------------') 


for i_csv in range(1,head_name_count):
    loading_name = input(f'输入第{i_csv+1}个表格名（直接复制文件名，不复制.csv）：')
    head_name.append(loading_name)
    with open(loading_floder + '\\' + loading_name + '.csv', newline='',encoding='utf-8-sig') as sample_list:
        reader = csv.reader(sample_list)
        for sample_row in reader:
            str_sample_name = ''.join(sample_row)
            if  str_sample_name in total_list:
                total_list[str_sample_name][i_csv] = '1'
            else:
                #生成新的判断式
                new_sample_info = []
                for i_info in range(head_name_count):
                    new_sample_info.append('0')
                new_sample_info[i_csv] = '1'          
                total_list[str_sample_name]=new_sample_info
    print('------------------------------------------------')

time.sleep(0.5)
print('汇总完成！')
print('------------------------------------------------')

save_floder = input('输入希望保存汇总文件的文件夹地址：')
with open(save_floder + '\\' + 'total_compounds.csv','a', newline='',encoding='utf-8-sig') as total_list_writer:
    writer = csv.writer(total_list_writer)
    writer.writerow(head_name)
    for compounds in total_list:
        writer.writerow([compounds,'-'.join(total_list[compounds])])
    print('文件已生成')

python赋值变量是浅拷贝，举个例子

t1，t2，t3赋值变量info，修改t1，t2，t3里的值，info也会改变，所有值为info的地方都会变

理想状态的编号也没看到规律啊