bwa mem -Cpt8 ref.fa - \
bwa mem原本的用法:
bwa mem ref.fa reads.fq > aln.sam
并未提及。因为没有生信分区,所以在linux话题里提这个问题,感谢帮助!
\ linux的根目录 -xxx options,选项,分长选项和短选项,长选项用--开头,短选项用-开头,短选项可合并,比如-r -f 可缩写为-rf 不带-的:params,参数