想要分析细菌几个菌株基因组的SNP，并以SNP density的形式可视化出来，查到有文章用mauve对齐基因组，用自己的脚本处理数据，并用R画图，自己做的时候perl脚本不太会改，想问有没有别的程序可以做？
这种东西都是自己开发适配的，没有现成的，自己研究吧