进行的是某种植物的GWAS分析,用GEMMA进行LMM+PCA+协变量,加入协变量文件的时候就会报错显示GSL ERROR: matrix is singular in lu.c at line 266 errno 1,去掉协变量文件就可以运行,看了说明手册,有点迷糊,求大神指点迷津……
说明文档里是这么说的
协变量的文件格式是这样的
参考的是邓老师的方法https://blog.csdn.net/yijiaobani/article/details/106220289
已经解决了,cov文档第一列截距删掉😂