请教一个小弟思考一天都没法理解的诡异问题，探讨问题原因

主要框架: Spring3.0 + ibatis2.3 + Hibernate3.2 + Struts2.2（struts2-spring-plugin-2.2.1.jar）
大体代码如下:
class TestAction extends ActionSupport {

 private AppSevice appService;

 //set/get 方法省略

 public String commit() {
 //第一种方式,
 appService.commit(xxx);

//第二种方式
  appService = (AppService)AppContextFactory.getSpringContext().getBean("appService");
 appService.commit(xxx);
}

}

public class AppContextFactory {
private static ClassPathXmlApplicationContext context = null;

public static BeanFactory getSpringContext() {
    if (context == null) {
        context = new ClassPathXmlApplicationContext(new String[] { "applicationContext-test.xml" });
    }
    return (BeanFactory) context;
}

}

补充说明appService.commit()中分为业务流程(使用hibernate)交易和业务功能交易(使用ibatis)
问题来了，当使用第一种方式时一旦业务功能交易出错，业务功能交易可以完全回滚，业务流程交易无法回滚；
当使用第二种方式时，可以实现业务流程业务功能交易的一致性，全部都回滚；
希望各位高手给些意见，很想把这个问题搞清楚;