pycharm的虚拟环境是什么原理啊

每次用pycharm新建工程如果选择了虚拟环境，那么会在项目目录下生成一个 环境的目录，里面就有Python解释器以及一些包。这样做说是为了不污染主环境。但是，我重装过Python之后，我的很多库都无被pycharm识别了。。。 比如说 tkinter 这是Python3.5以上内置的的吧，pycharm会打波浪线，然后Ctrl ➕ 左键 也无法追溯源码。 不知道为什么会这样?是因为我新装的Python3.9的bug吗？ 但是代码可以跑起来，只是pycharm无法识别并且无法给出代码补全。。。所以想请教一下pycharm的虚拟环境到底是什么鬼？以及如何配置一个比较好的环境。

使用python目录下的第三方库，