ERROR hhsuite FFindexDatabase

cfg.hhlib = '/home/jia/anaconda3/pkgs/hhsuite-3.3.0-py37pl526hfa133b6_0'
cfg.database = '/mnt/sharefile/jbl/UniRef30'
# calculate HMM feature
tmp_dir = HMM_DIR + '/' + name
os.system('mkdir ' + tmp_dir)
os.system('cp ' + TEST_DIR + '/' + file + ' ' + tmp_dir)

comm = ('export HHLIB=' + cfg.hhlib + ' &&'
        + 'export PATH="$PATH:' + cfg.hhlib + '/bin:' + cfg.hhlib
        + '/scripts" && ' + cfg.hhlib + '/bin/hhblits -i '
        + tmp_dir + '/' + file + ' -n 3 -e 0.001 -d ' + cfg.database
        + ' -cpu 6 -ohhm ' + HMM_DIR + '/' + name + '.ohhm -diff inf -id 99 -cov 50')
os.system(comm)

 

- 21:43:24.514 INFO: Search results will be written to /mnt/sharefile/jbl/AHs/example/features/HMM/1CCMA/1CCMA.hhr

- 21:43:24.539 ERROR: In /opt/conda/conda-bld/hhsuite_1598678489476/work/src/ffindexdatabase.cpp:11: FFindexDatabase:

- 21:43:24.539 ERROR:     could not open file '/mnt/sharefile/jbl/UniRef30_cs219.ffdata'

 

根据错误提示,程序无法打开文件/mnt/sharefile/jbl/UniRef30_cs219.ffdata。
请检查文件是否存在,以及程序是否具有访问该文件的权限。
如果文件确实存在,并且程序有权限访问它,那么可以尝试使用绝对路径来指定文件,而不是相对路径。
你还可以确保文件名的大小写与实际文件名匹配。