利用python抽出指定文件内容 抽取特定基因id对应的FPKM

  可以用行读取文本文件,列表解析式解析出带有“transcript”字符串的行。


#!/sur/bin/nve python
# coding: utf-8


with open(filename) as f:
    textlines = f.readlines() # 行读取文件。
    transcripts = [i for i in textlines if 'stranscript' in i] # 解析文本文件中带有'stranscript'字符串的行。

  接下来可以进行下一步处理。