rna_seq用star软件建立索引，提示缺少外显子，如何解决，谢谢？

我们在rna_seq建立索引的时候出错了，它说缺少外显子，但我们的数据是线粒体的dna，没有内外显子，只有CDS和mrna，这该怎么解决呀？