这两种流解析配置文件方式有什么具体的区别?

InputStream is = this.getClass().getClassLoader().getResourceAsStream("SqlMapConfig.xml");

InputStream is = Resources.getResourceAsStream("SqlMapConfig.xml");

Resources 是指org.apache.ibatis.io.Resources这个类吗?

他们用法一样的, Resources.getResourceAsStream 做了封装,底层还是委托ClassLoader.getSystemClassLoader() 去处理的,
跟this.getClass().getClassLoader()是同一个类。