我在一个项目中建了多个模块，他们属于maven，
（1）Login（登录模块），
（2）Register（注册模块），
（3）PassWord（密码模块），
（4）Certification（认证模块），
（5）Commons（公共模块）。
这几个模块中都有Controller、Service、model、repository 层。
这样的项目该怎么去整合springboot和mybatis？
按照我的理解是，你这几个模块分成不同的开发完成的，你用maven依赖配置就可以了。
创建一个maven父工程，其他模块被创建成子工程，都依赖父工程，父工程实现pom文件的jar包依赖的版本管理，配置文件在resource下的application.properties中配置
entitymanager.packagesToScan= com.dream.shopping
spring.datasource.url=jdbc:mysql://120.77.153.127:3306/shopping?characterEncoding=utf-8
spring.datasource.username=admin
spring.datasource.password=123456
spring.datasource.driver-class-name=com.mysql.jdbc.Driver
，然后创建一个AppConfig类
@MapperScan(basePackages={"mappers"})
@ComponentScan("com.dream.shopping")
@SpringBootConfiguration
public class APPConfig {
}
创建启动文件即可，楼主的项目其实是一个springboot的前后端分离的分布式项目，可以使用Springcloud做更方便