使用muscle进行了多序列比对，但是想要建树时，总是提示数据不正确，如图所示：
使用iqtree建树时会提示：
iqtree -s text.phy -m MFP -b 1000 -nt AUTO（原命令）
Reading alignment file text.phy ... Phylip format detected
ERROR: Sequence pfu____aug2.0 contains not enough characters (1680)
ERROR: Duplicated sequence name Cluster-17
使用phyml建树时会提示：
PhyML -i text.phy -d aa -b 1000 -m LG -f m -v e -a e -o tlr（原命令）
. Err: Symbol "." should not appear in the first sequence
. Type enter to exit.
. One or more missing sequences in block 1.
. Type enter to exit.
我尝试对用Mafft进行多序列比对，但是得到的fasta数据不知该如何转换成phylip格式。现在卡在了对数据的处理阶段，急需帮助！感谢！